เป็นภาคต่อของเรื่อง นารูโตะ นินจาจอมคาถา เรื่องราวนี้วนเวียนอยู่กับ อุซึมากิ นารูโตะ ที่แก่กว่าและโตกว่าเล็กน้อยและภารกิจของเขาที่จะช่วย อุซึมากิ นารูโตะ เพื่อนของเขาจากการจับของ Shinobi ที่มีลักษณะคล้ายงู โอโรจิมารุ หลังจากผ่านไป 2 ปีครึ่งในที่สุดนารูโตะก็กลับมาที่หมู่บ้านโคโนฮะของเขาและตั้งเป้าที่จะวางความทะเยอทะยานในการทำงานแม้ว่ามันจะไม่ใช่เรื่องง่ายก็ตามเนื่องจากเขาได้รวบรวมศัตรู (ที่อันตรายกว่า) สองสามตัวไว้ในองค์กรชิโนบิ ; แสงอุษา.

ในอีกโลกหนึ่งนินจาเป็นผู้มีพลังสูงสุดและในหมู่บ้านที่ซ่อนอยู่ในใบไม้จะมีนินจาที่ซ่อนตัวอยู่ในดินแดน เมื่อสิบสองปีก่อนสุนัขจิ้งจอกเก้าหางที่น่ากลัวได้เข้ามาคุกคามหมู่บ้านและอ้างว่ามีหลายชีวิตก่อนที่มันจะถูกปราบและวิญญาณของมันถูกผนึกไว้ในร่างของเด็กทารก เด็กชายคนนั้นนารูโตะอุซึมากิเติบโตขึ้นจนกลายเป็นนินจาฝึกหัดที่สนใจการเล่นแผลง ๆ มากกว่าการเรียนวิชานินจา .. แต่นารูโตะมุ่งมั่นที่จะเป็นนินจาที่ยิ่งใหญ่ที่สุดตลอดกาล!

คาเมนไรเดอร์ Masked Rider | เมื่อโลกที่ถูกรุกรานจากองค์การก่อการร้ายอันลึกลับ ฮอนโกได้ใช้พลังที่เขามีจากการดัดแปลง เพื่อต่อกรกับเหล่าวายร้ายในฐานะคาเมนไรเดอร์