มีเนื้อเรื่องเกี่ยวกับเจ้าหน้าที่พิเศษเอฟบีไอสองคน คือ ฟอกซ์ มัลเดอร์ นักจิตวิทยา (รับบทโดยเดวิด ดูคอฟนี) และแดนา สกัลลี นักฟิสิกส์และแพทย์ (รับบทโดยจิลเลียน แอนเดอร์สัน) มีหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับแฟ้มคดี "เอ็กซ์" คดีลึกลับเกี่ยวกับปรากฏการณ์เหนือธรรมชาติ ทั้งสองคนอยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของวอลเตอร์ สกินเนอร์ (รับบทโดยมิตช์ พีเลจจี) ผู้ช่วยผู้อำนวยการเอฟบีไอ

เรื่องราวของแพทริค เจน (ไซม่อน เบเกอร์) จิตแพทย์ชื่อดังที่เสียลูกและเมียไปด้วยน้ำมือของฆาตกรฆ่าต่อเนื่องนาม เรด จอห์น ซึ่งแพทริคจะใช้ความสามารถในอ่านใจ วิเคราะห์จิต สังเกตุพฤติกรรมต่างๆเพื่อช่วยตำรวจในการนำคนร้ายมาลงโทษด้วยกฏหมายในแต่ละตอน