ด็อกเตอร์ฮู จะดำเนินเรื่องเกี่ยวกับตัวละครหลักของเรื่องซึ่งเป็นเจ้าแห่งกาลเวลาจากดาวแกลลิเฟรย์ ที่มีชื่อว่า "เดอะด็อกเตอร์" เขาหลบหนีมาจากแกลลิเฟรย์โดยขโมยทาร์ดิส ซึ่งเป็นไทม์มะชีนที่สามารถพาเขาไปที่ไหนก็ได้ในห้วงเวลาและอวกาศ ทาร์ดิสจะมี "วงจรกิ้งก่า" โดยปกติแล้วจะทำให้ยานนี้เมื่อลงจอดที่ไหนก็ตาม มันก็จะเปลี่ยนรูปลักษณ์ภายนอกให้กลบกลืนกับสถานที่นั้น แต่อย่างไรก็ตาม ทาร์ดิสของดอกเตอร์ก็ได้ติดอยู่ในรูปร่างของตู้โทรศัพท์สีน้ำเงินของอังกฤษเนื่องจากความผิดพลาดในวงจรกิ้งก่า

ขณะที่สองเผ่าพันธุ์ทำสงครามห้ำหั่นกัน ลูกชายของพ่อมดชื่อกระฉ่อนซึ่งเคยก่อเหตุสังหารหมู่สุดสะพรึง พยายามค้นหาตัวตนและพลังของตัวเอง

ชายหนุ่มเจ้าเสน่ห์ที่เต็มไปด้วยอันตรายและความหมกมุ่นทำทุกวิถีทางเพื่อเข้าไปมีส่วนในชีวิตของคนที่เขาลุ่มหลงอย่างถอนตัวไม่ขึ้น