เริ่มต้นที่รุ่งอรุณแห่งกาลเวลา มินเนี่ยน ที่เริ่มจากการเป็นสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวสีเหลือง ได้ผ่านการวิวัฒนาการและทำหน้าที่รับใช้บรรดาเจ้านายวายร้ายแสบขั้นเทพ พวกมินเนี่ยนที่ล้มเหลวตลอดกาลในการรักษาชีวิตเจ้านายของตัวเองเอาไว้ นับจาก ที.เร็กซ์ จวบจนถึงนโปเลียน พวกมันพบว่าตัวเองไร้เจ้านายและจมอยู่ในความหดหู่ แต่มินเนี่ยนตัวหนึ่งชื่อเควิน มีแผนการและได้ร่วมมือกับสตวร์ทจอมเกรียนและบ็อบน้อย ผู้น่ารัก ในการออกผจญภัยในโลกกว้างเพื่อหาเจ้านายวายร้ายคนใหม่สำหรับมันและเพื่อนพ้อง ทั้งสามได้ออกผจญภัยสุดระทึก ซึ่งในท้ายที่สุดทำให้พวกมันไปพบกับผู้ที่อาจจะเป็นเจ้านายใหม่ สการ์เล็ต โอเวอร์คิล จอมวายร้ายหญิงคนแรกของโลก พวกมันเดินทางจากทวีปเยือกแข็งแอนตาร์กติกามายังนิวยอร์กซิตี้ในยุค 60’s และไปลงเอยอยู่ในลอนดอน ที่ซึ่งพวกมัน จะต้องเผชิญหน้ากับความท้าทายที่ยิ่งใหญ่ที่สุดจนถึงตอนนี้ นั่นคือการปกป้องเหล่า มินเนี่ยน...จากการถูกกำจัด

กรูตกงานหลังพลาดการจับตัวดาราเด็กยุค 80 ที่กลายเป็นสุดยอดวายร้าย แต่เขาก็ได้ค้นพบว่าตัวเองมีน้องชายฝาแฝดที่พลัดพรากจากกันมานาน

เมื่อขบวนการมหาวายร้ายในดวงใจไม่ยอมรับเข้าแก๊ง เด็กชายกรูวัย 12 ปี จึงตั้งหน้าตั้งตาพิสูจน์ธาตุแท้อันร้ายกาจของตัวเอง โดยได้รับความช่วยเหลือจากเหล่าสมุนมินเนี่ยนจอมป่วน