อุลตร้าแมนคอสมอส นักรบแห่งความเมตตาและอ่อนโยน ผู้มาจากสภาแห่งอวกาศ มีหน้าที่คอยทำให้เกิดสันติในดาวที่ได้รับมอบหมาย คอสมอสได้ให้หินทอประกายแก่มุซาชิ เพื่อสามารถเรียกคอสมอสได้ในเวลาคับขัน ซึ่งในการเรียกนั้นต้องมีความอ่อนโยนและ กล้าหาญ อย่างบริสุทธิ์ใจ จึงจะสามารถเรียกคอสมอสได้ มุซาชิได้รวมร่างกับ หินทอประกายแสงได้กลายเป็นคฑาคอสโม่เพื่อให้มุซาชิแปลงร่างเป็นคอสมอสได้ มุซาชิได้เติบโตเป็นหนุ่มและกำลังสานฝันของตัวเองให้เป็นจริง แต่โลกกำลังถูกเชื้อไวรัสจากต่างดาที่โจมตีโลกและเข้าควบคุมสัตว์ประหลาดให้ออกอาละวาด อุลตร้าแมนคอสมอสกับมุซาชิจึงรวมร่างกันเพื่อปกป้องโลกนี้