มีเนื้อเรื่องเกี่ยวกับเจ้าหน้าที่พิเศษเอฟบีไอสองคน คือ ฟอกซ์ มัลเดอร์ นักจิตวิทยา (รับบทโดยเดวิด ดูคอฟนี) และแดนา สกัลลี นักฟิสิกส์และแพทย์ (รับบทโดยจิลเลียน แอนเดอร์สัน) มีหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับแฟ้มคดี "เอ็กซ์" คดีลึกลับเกี่ยวกับปรากฏการณ์เหนือธรรมชาติ ทั้งสองคนอยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของวอลเตอร์ สกินเนอร์ (รับบทโดยมิตช์ พีเลจจี) ผู้ช่วยผู้อำนวยการเอฟบีไอ

การผจญภัยของเดอะด็อกเตอร์ มนุษย์ต่างดาวเดินทางข้ามกาลเวลาที่รู้จักกันในชื่อไทม์ลอร์ด เขาสำรวจจักรวาลด้วยควานหาซึ่งเป็นยานอวกาศเดินทางข้ามเวลาที่มีความรู้สึก ภายนอกปรากฏเป็นป้อมตำรวจสีน้ำเงินของอังกฤษ ซึ่งพบเห็นได้ทั่วไปในอังกฤษเมื่อปี 1963 เมื่อซีรีส์นี้ออกอากาศครั้งแรก นอกจากสหายผู้สืบทอดแล้ว เดอะด็อกเตอร์ ยังต้องเผชิญกับศัตรูมากมายในขณะที่ทำงานเพื่อปกป้องอารยธรรม ช่วยเหลือผู้คนธรรมดา และแก้ไขข้อผิดพลาดมากมาย

เมื่อนักสืบมือใหม่โน้มน้าวตำรวจว่าเขามีพลังจิต เขาและเพื่อนสนิทที่ไม่เต็มใจก็ได้รับการว่าจ้างให้เป็นที่ปรึกษาเพื่อช่วยแก้ไขคดีที่ซับซ้อน