ที่แอตแลนติสราชินีถูกลำแสงดูดหายขึ้นไปบนท้องฟ้าเหลือไว้แค่กำไลข้อมือไว้ให้เจ้าหญิงคีดาที่ตอนนั้นยังเป็นเด็ก ตัดกลับมาที่ปัจจุบันไมโลนักภาษาศาสตร์เชื่อว่ามีดินแดนแอตแลนติสอยู่จริงตามหลักฐานบันทึกของคนเลี้ยงแกะที่ปู่เคยเล่าให้ฟังตั้งแต่สมัยไมโลยังเด็ก ไมโลเตรียมเสนอผลงานเพื่อขอทุนแต่ถูกนักวิจัยคนอื่นกลั่นแกล้ง ไมโลถูกใช้ให้ทำงานดูแลท่อน้ำอยู่ใต้พิพิธภัณฑ์ ไมโลยื่นจดหมายลาออกถ้าไม่ได้ทุนเจ้าของพิพิธภัณฑ์ไม่สนใจไมโล ไมโลกลับไปที่บ้านเจอกับเฮลกาที่มาแจ้งข่าวกับไมโลว่ามีคนต้องการพบ ไมโลตามเฮลกาไปพบกับเพรสตัน วิธมอร์ที่เป็นเพื่อนกับปู่ของไมโล วิธมอร์ให้พัสดุเป็นบันทึกคนเลี้ยงแกะที่ปู่ของไมโลส่งมาพร้อมกับเสนองานสำรวจแอตแลนติสให้ไมโล ไมโลออกเดินทางพร้อมกับทีมสำรวจมือหนึ่งที่วิธมอร์สรรหามาได้แก่ โรคผู้บังคับการ เฮลกา โมลนักขุดเจาะ ดร.สวีทที่เป็นหมอ ออเดรย์ช่างเครื่อง คุกกีพ่อครัวและแพคการ์ดเจ้าหน้าที่สื่อสาร

อาชญากรวางแผนที่จะแทรกซึมเข้าสู่คุกไฮเทคเพื่อชักจูงให้ชายที่ต้องโทษประหารชีวิตเปิดเผยที่ซ่อนขุมสมบัติที่เขาได้มาจากการปล้นที่ยังไม่ได้ถูกไขคดี