ด็อกเตอร์ฮู จะดำเนินเรื่องเกี่ยวกับตัวละครหลักของเรื่องซึ่งเป็นเจ้าแห่งกาลเวลาจากดาวแกลลิเฟรย์ ที่มีชื่อว่า "เดอะด็อกเตอร์" เขาหลบหนีมาจากแกลลิเฟรย์โดยขโมยทาร์ดิส ซึ่งเป็นไทม์มะชีนที่สามารถพาเขาไปที่ไหนก็ได้ในห้วงเวลาและอวกาศ ทาร์ดิสจะมี "วงจรกิ้งก่า" โดยปกติแล้วจะทำให้ยานนี้เมื่อลงจอดที่ไหนก็ตาม มันก็จะเปลี่ยนรูปลักษณ์ภายนอกให้กลบกลืนกับสถานที่นั้น แต่อย่างไรก็ตาม ทาร์ดิสของดอกเตอร์ก็ได้ติดอยู่ในรูปร่างของตู้โทรศัพท์สีน้ำเงินของอังกฤษเนื่องจากความผิดพลาดในวงจรกิ้งก่า

อาลีนา สตาร์คอฟ สาวกำพร้านักวาดแผนที่ตกเป็นเป้าของกลุ่มอำนาจชั่วทั่วสารทิศ หลังจากปลดปล่อยพลังพิเศษที่อาจพลิกชะตาของโลกท่ามกลางวิกฤตของสงคราม

หลังจากถูกจองจำมาเนิ่นนาน มอร์เฟียส ราชาแห่งความฝัน ก็ออกเดินทางข้ามโลกเพื่อตามหาสิ่งที่ถูกพรากไปและทวงคืนพลังอำนาจที่เคยมี... เป็นการผสมผสานตำนานสมัยใหม่และแฟนตาซีลึกลับเข้าด้วยกันจนมาเป็นเรื่องเล่าร่วมสมัย ดราม่าทางประวัติศาสตร์ และตำนานที่เชื่อมโยงเป็นเรื่องเดียว ซีรีส์เรื่องนี้ตามติดชีวิตผู้คนและสถานที่ต่างๆ ที่ได้รับผลกระทบจากมอร์เฟียส จ้าวแห่งความฝันที่พยายามแก้ไขความผิดพลาดที่ตัวเองก่อไว้ตลอดชีวิตอันคงกระพันทั้งตอนที่อยู่ในจักรวาลและในโลกมนุษย์...