หลังจากที่สิ่งมีชีวิตที่ไม่ปรากฏชื่อที่เรียกว่า "ผู้ไร้ตัวตน" เริ่มปรากฏขึ้น ในไม่ช้าพวกเขาก็ตามด้วยยมทูตชื่อ เซ็นนะ ที่ทำให้พวกเขาหายตัวไป ยังเป็นปริศนากับสิ่งมีชีวิตที่ไม่รู้จักเหล่านี้และหญิงสาวที่ลึกลับยิ่งกว่านั้น อิจิโกะและลูเคียออกเดินทางเพื่อเรียนรู้เพิ่มเติม แต่ค้นพบแผนการชั่วร้ายเมื่อกลุ่มที่คุกคามพยายามลักพาตัวเซ็นนะ

ฮาตาเกะ คาคาชิ ผู้เป็นอาจารย์ได้สั่งให้ นารูโตะ ซาสึเกะ และ ซากุระ มาดูหนังเรื่องเจ้าหญิงฟุอุนก่อนปฏิบัติภารกิจ เพราะภารกิจคือการคุ้มครอง “ฟูจิคาเสะ ยูคิเอะ” ดาราสาวที่แสดงเป็นเจ้าหญิงฟุอุน ไปถ่ายหนังที่แคว้นยูกิ ซึ่งยูคิเอะไม่ยอมไปและหนีทุกวิถีทาง พวกนารูโตะจึงคอยตามตัวกลับมาและคุ้มครองให้การถ่ายทำหนังเสร็จสิ้น

วันนึง นินจาลึกลับผู้มาจากแคว้นโซระซึ่งน่าจะล่มสลายไปแล้วจากฝีมือของโคโนฮะ ก็กลับมาถล่มโคโนฮะเพื่อแก้แค้น ระหว่างที่ต่อสู้กันอยู่นั้น นารูโตะ บังเอิญไปเจอลุงแก่ๆคนนึง มาช่วยรักษาคนเจ็บในหมู่บ้าน และก็หายไปก่อนที่นารูโตะจะได้ถามชื่อ หลังจากนั้นนินจาแคว้นโซระก็ถอยกลับไป

อิลิยาได้เรียนรู้อะไรหลาย ๆ อย่างหลังผ่านการต่อสู่กับเอนสเวิร์ธ: ทั้งอดีตของมิยุ และโลกคู่ขนานของชิโร่ รวมทั้งสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ที่กำลังจะเกิดขึ้นในโลกนี้ นี่คือเรื่องราวเกี่ยวกับชะตากรรมอันน่าเศร้าของมิยุ และสงครามการต่อสู้เพื่อช่วยเหลือน้องสาวของชิโร่

16 ปีที่แล้ว ชายสวมหน้ากากในนามว่า โทบิ ได้ปลดปล่อยปิศาจจิ้งจอกเก้าหางออกมารุกรานหมู่บ้านโคโนฮะ แต่นามิคาเสะ มินาโตะ ผู้นำหมู่บ้านและอุซึมากิ คุชินะ ภรรยาของเขาสามารถกำราบได้สำเร็จ โดยผนึกพลังของจิ้งจอกเก้าหางไว้ในร่างของลูกชายนามว่า อุซึมากิ นารูโตะ ปัจจุบัน ชาวบ้านต่างอยู่เย็นเป็นสุข แต่ความสงบสุขก็ถูกทำลายเมื่อมีองค์กรนินจาลึกลับนามว่า แสงอุษา ได้บุกโจมตีหมู่บ้านโคโนฮะ นารูโตะตกตะลึงว่าทำไมองค์กรแสงอุษาจึงกลับมา ทั้งที่พวกเขาน่าจะตายไปนานแล้ว ขณะเดียวกันชายสวมหน้ากากก็ใช้คาถาลึกลับทำร้ายนารูโตะและซากุระ แล้วส่งพวกเขาไปอยู่ในโลกอีกมิติหนึ่งที่ผองเพื่อนและบรรดาอาจารย์ของพวกเขาได้เปลี่ยนไปยังกะคนละคน ซาสึเกะกลายเป็นหนุ่มเพลย์บอย ฮินาตะกลายเป็นสาวมั่นสุดร้อนแรง รวมถึงพ่อแม่ของนารูโตะยังมีชีวิตอยู่ และตำนานนินจาโฮคาเงะก็อาจจะเปลี่ยนไปด้วย

นรก - สถานที่สำหรับสิ่งมีชีวิตที่ได้ทำบาปมหันต์ในช่วงที่ยังมีชีวิตอยู่ เป็นดินแดนที่แม้แต่ยมทูตก็ถูกห้ามไม่ให้เข้าไปยุ่ง เมื่อกลุ่มคนชั่วร้ายวางแผนหลบหนีจากคุกนิรันดร์นี้ พวกเขากลับพบว่าตัวแทนยมทูตนามว่า คุโรซากิ อิจิโกะ คือกุญแจสู่อิสรภาพ คนบาปเหล่านั้นเริ่มโจมตีและทำการลักพาตัวยูสุ ซึ่งเป็นน้องสาวของอิจิโกะแล้วพาเธอไปที่นรก ด้วยความช่วยเหลือของชายลึกลับนามว่าโคคุโตะ อิจิโกะและ

10 ปีหลังสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ครั้งล่าสุด เอมิยะ ชิโร่ ได้ใช้ชีวิตอย่างสงบสุขในเมืองฟุยูกิ โดยมีรุ่นน้องของเขา มาโต้ ซากุระ คอยอยู่ข้างกายทุกๆ วัน จนกระทั่งสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ครั้งใหม่ได้เริ่มต้นขึ้น เขาได้ถูกดึงเข้าสู่สงครามโดยการเรียก Servant Saber และตัดสินใจยืนหยัดต่อสู้ในสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ที่ชี้ชะตาเหล่าจอมเวทย์เพื่อความปรารถนาของพวกเขา

"ฝ่ายตรงข้ามที่ฉันต้องต่อสู้ ยังคงอยู่ในเมืองนี้" เด็กหนุ่มตัดสินใจที่จะต่อสู้ต่อไป เพื่อปกป้องเด็กสาวสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ ที่เหล่าจอมเวท (มาสเตอร์) และจิตวิญญาณแห่งวีรชน (เซอร์วานท์) เข้าต่อสู้เพื่อนำไปสู่การครอบครอง จอกศักดิ์สิทธิ์สงครามครั้งใหม่ได้เริ่มขึ้นอีกครั้ง ณ เมืองฟุยุกิ เมื่อ 10 ปีให้หลังจากสงครามครั้งที่แล้วแต่แล้ว การมาของมาโต้ โซเค็น ผู้เป็นหนึ่งในสามตระกูลที่สร้างสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ ทำให้สิ่งต่างๆเริ่มบิดเบี้ยวและเลวร้ายยิ่งขึ้น เมื่อโซเค็นอัญเชิญเซอร์วานท์ แอสซาซินที่แท้จริงออกมา เงามืดที่ไม่มีใครรู้จักครอบคลุมเมือง สังหารเหล่ามาสเตอร์ และเซอร์วานท์ทีละคน เอมิยะ ชิโร่ ผู้ซึ่งได้ต่อสู้ในฐานะมาสเตอร์ในสงครามครั้งนี้ได้รับบาดเจ็บและสูญเสียเซอร์วานท์ เซเบอร์ไป ด้วยการตัดสินใจที่จะปกป้องมาโต้ ซากุระ เขาจึงปฏิเสธที่จะออกจากสนามรบในขณะที่ซากุระกังวลเกี่ยวกับชิโร่นั้น เธอเองก็ต้องเองพัวพันกับชะตากรรมของตนในฐานะจอมเวท "ฉันสัญญาฉันจะ ... "เขาตัดสินใจว่าจะไม่ทรยศต่อเธอ อย่างไรก็ตามความปรารถนาอันแรงกล้าของพวกเขากำลังถูกบดบังด้วยเงามืด

โบรูโตะเป็นลูกชายของโฮคาเงะนารูโตะคนที่ 7 ที่ปฏิเสธพ่อของเขาโดยสิ้นเชิง เบื้องหลังสิ่งนี้เขามีความรู้สึกอยากจะเหนือกว่านารูโตะผู้ซึ่งได้รับความเคารพในฐานะวีรบุรุษ เขาได้พบกับซาสึเกะเพื่อนพ่อของเขาและขอเป็น ... เด็กฝึกงานของเขา!? ม่านเรื่องราวของคนรุ่นใหม่ที่เขียนโดย Masashi Kishimoto ดังขึ้น

หลังจากที่โออินล้ำค่าถูกขโมยโดยฮิตสึกายะ โทชิโร่ก็หายตัวไปและกลายเป็นผู้ต้องสงสัยในข้อหากบฏ เมื่อโซลโซไซตี้เรียกร้องให้จับกุมและประหารชีวิต ยมทูต อิจิโกะ คุโรซากิ สาบานที่จะพิสูจน์ความบริสุทธิ์ของฮิตสึกายะ

ซิเอลได้ทราบเรื่อง "สมาคมออโรร่า" ซึ่งมีข่าวลือว่ากำลังทำการวิจัยวิธีทำให้คนตายกลับมามีชีวิตอีกครั้ง การประชุมครั้งต่อไปของพวกเขามีกำหนดจัดขึ้นบนเรือคัมปาเนีย ซึ่งแล่นข้ามมหาสมุทรแอตแลนติก ซิเอลผิดหวังมากเมื่อเอลิซาเบธ "ลิซซี่" มิดฟอร์ดขึ้นเรือลำเดียวกัน ทำให้เขาไม่มีทางเลือกอื่นนอกจากต้องขึ้นเรือลำนั้นด้วย

009 Re:Cyborg เป็นเรื่องราวเกี่ยวกับกลุ่มไซบอร์ก 9 คน ซึ่งแต่ละกลุ่มถูกสร้างขึ้นโดยองค์กรลึกลับเพื่อใช้เป็นอาวุธต่อต้านมนุษยชาติ กลุ่มนี้หันไปหาผู้สร้างเพื่อปกป้องประชากรแทน โดยใช้พลังที่ได้รับมาต่อสู้กับผู้สร้าง

สองปีหลังจากเหตุการณ์ในสงครามมหานินจาครั้งที่ 4 ดวงจันทร์ที่ Hagoromo Otsutsuki สร้างขึ้นเมื่อนานมาแล้วเพื่อปิดผนึกรูปปั้นเกโดะเริ่มเคลื่อนลงมาสู่โลกโดยขู่ว่าจะกลายเป็นดาวตกที่จะทำลายทุกสิ่งที่ส่งผลกระทบ ท่ามกลางวิกฤตนี้ Kaguya Otsutsuki ทายาทสายตรงชื่อ Toneri Otsutsuki พยายามที่จะลักพาตัว Hinata Hyuga แต่กลับลักพาตัว Hanabi น้องสาวของเธอไป ตอนนี้นารูโตะและพรรคพวกทำภารกิจช่วยเหลือก่อนที่จะพบว่าตัวเองเข้าร่วมการต่อสู้ครั้งสุดท้ายเพื่อตัดสินชะตากรรมของทุกสิ่ง