คริสต์ศักราชที่ 21 หลังจากที่มนุษย์ได้พบกับสิ่งมีชีวิตลึกลับจากต่างดาว EI-01 ได้สองปี ได้มีการตั้งหน่วยงาน Gusty Geoid Guard เรียกย่อๆว่า GGG ขึ้นเพื่อคอยรับมือการโจมตีของเหล่า "ซอนดาเรี่ยน" ที่อาศัยการเข้าสิงร่างมนุษย์โดยการหลอมรวมกับเครื่องจักรกลและจิตด้านลบของมนุษย์ และสมาชิกคนสำคัญของหน่วย GGG ในการกำจัดเหล่าผู้รุกรานนี้ก็คือ ชิชิโอ ไก นักบินอวกาศที่รอดตายจากเหตุการณ์เมื่อสองปี และตอนนี้เขาได้ถูกดัดแปลงและเปลี่ยนร่างกายเป็นไซบอร์กที่สามารถรวมร่างกับหุ่นยนต์สิงโตกาเลออนจนกลายเป็น เกราะจักรกลไกการ์ และ สามารถรวมร่างสุดท้ายกับกาโอแมชชีนจนกลายร่างเป็นหุ่นยักษ์ "กาโอไกการ์" ที่สามารถเข้าต่อสู้กับ ซอนดาเรี่ยน และสามารถดึงแกนกลาง "ซอนเดอร์เมทัล" ให้ อามามิ มาโมรุ เด็กชายที่มีพลังพิเศษ "ชำระล้าง" เมทัลเหล่านั้นได้ ถึงเวลาแล้วที่เหล่านักรบราชันย์ผู้กล้าจะออกกำจัดเหล่าร้ายให้สิ้นไปจากโลกใบนี้

หลังจากชัยชนะของ Gutsy Galaxy Guard เหนือจักรวรรดิ Zonder และ 31 Primevals ภัยคุกคามใหม่ก็ปรากฏตัวบนโลก GGG - กับ Guy Shishio และ GaoFighGar ที่สร้างขึ้นใหม่ - ร่วมมือกับ Chasseur คู่หูชาวฝรั่งเศสเพื่อต่อสู้กับ BioNet องค์กรชั่วร้าย หนึ่งในกลุ่มของ Chasseur คือ Renais Cardiff Shishioh อดีตไซบอร์ก BioNet ที่มุ่งหมายทำลายล้างผู้ที่พรากมนุษยชาติของเธอไป แต่ในขณะที่ GGG และ Chasseur ต่อสู้กับ BioNet ฐานของ GGG ทั่วโลกก็ถูกโจมตีอย่างกะทันหัน และ "Q-Parts" ที่เพิ่งค้นพบและ Gao Machines ดั้งเดิมก็ถูกขโมยไปโดย Mamoru Amami ซึ่งถูกลักพาตัวและโคลนนิ่งโดยแม้แต่ ภัยคุกคามที่ยิ่งใหญ่กว่าที่เรียกว่า "สิบเอ็ดราชาแห่งโซล" เมื่อถูกสหประชาชาติขับไล่ออกจากโลก GGG ต้องเดินทางไปยังสุดขอบกาแล็กซีเพื่อต่อสู้กับราชาแห่งโซลทั้ง 11 และช่วย Mamoru ก่อนที่มันจะสายเกินไป

เมื่อมนุษย์ได้รับอันตรายจากภัยร้ายที่แฝงมาในรูปแบบต่างๆ เมื่อนั้นจะมีกลุ่มวีรบุรุษคอยปกป้องให้พ้นภัย เหล่ากลุ่มวีรบุรุษที่คอยปกป้องนั้นถูกเรียกขานกันว่า ขบวนการนักสู้ ซึ่งเป็นกลุ่มที่เกิดจากการร่วมมือของชายหญิงจำนวน 5 คน ที่มีพลังพิเศษหรือทักษะที่เหนือกว่ามนุษย์ทั่วไปเข้าต่อกรกับศัตรูที่หมายจะยึดครองโลกโกไคเจอร์ มีแนวคิดและคอนเซ็ปท์มาจาก โจรสลัด มหาศึกรวมพลังฮีโร่ สู่การต่อสู้ครั้งยิ่งใหญ่ เพื่อฉลองครบรอบการฉายขบวนการนักสู้ ที่รวมพลเหล่าฮีโร่ในความทรงจำที่ตระการตาที่สุดในประวัติศาสตร์ ! 35 เรื่องโดยโกไคเจอร์นั้นใช้วิธีการนำเสนอเรื่องราวที่ผูกโยงเนื้อหาของขบวนการนักสู้แต่ละเรื่อง เรียงร้อยไว้ด้วยกันนั้นเอง

นักเล่นเกมผู้ไร้เป้าหมายชีวิตและเพื่อน 2 คนได้หลุดเข้าไปในโลกคู่ขนานของโตเกียว ซึ่งบีบให้พวกเขาต้องเล่นเกมเสี่ยงตายเพื่อเอาชีวิตรอด